Predicción y análisis conformacional de biomoléculas

Abstract

La α-aminoglicina (Agl) es un derivado de la glicina, uno de los aminoácidos fundamentales. Se caracteriza por estar unido a un sustituyente amino en el carbono α, a mayores del ya presente en el aminoácido. El hecho de que este carbono posea dos sustituyentes idénticos hace que la molécula no sea quiral, una de las características más representativas de este tipo de sistemas moleculares. El objetivo de este trabajo es encontrar los confórmeros más estables, los más poblados en fase gas, de la molécula estudiada. Para ello, se llevarán a cabo diversos cálculos computacionales y, comparando todas ellas, se elige el mejor método para la obtención de sus confórmeros. Finalmente, se estudiarán las interacciones que estabilizan el sistema molecular.

The α-aminoglycine (Agl) is a glycine derivate, one of the fundamental aminoacids. An aditional amino sustituent bonded to the α carbon is the difference between the derivate and the aminoacid. The fact of having another amino group bonded to the α carbon makes the molecule not quiral, which is one of the characteristics of aminoacids. The aim of this work is to find the most stable and the most populated in gas phase, conformers of the studied molecule. To this end, several computational calculations are going to be used and, comparing all of them, the best method to obtain the conformers will be chosen. Finally, the interations that stabilize this molecular system are going to be studied.