First Report of an Extensively Drug-Resistant ST23 Klebsiella pneumoniae of Capsular Serotype K1 Co-Producing CTX-M-15, OXA-48 and ArmA in Spain

Abstract

Se secuenció el genoma completo de un aislado MS3802 de Klebsiella pneumoniae extremadamente resistente (XDR) procedente de un exudado de traqueotomía utilizando las plataformas MiSeq y Oxford Nanopore MinION para identificar la resistencia a los antimicrobianos y los determinantes de virulencia y su contexto genómico. El aislado MS3802 pertenecía al clon ST23 y presentaba un serotipo capsular K1, asociado a los aislados de K. pneumoniae hipervirulento (hvKp). El aislado albergaba un gen blaCTX-M-15 codificado cromosómicamente y contenía un gran plásmido híbrido de virulencia/resistencia IncHI1B que portaba otra copia del blaCTX-M-15 y los factores de virulencia iucABCD-iutA, iroBCDN, rmpA y rmpA2. El gen de la carbapenemasa blaOXA-48 se encontró en un transposón similar al Tn1999 y el gen de la metilasa del ARNr 16S armA se localizó en las proximidades de otros genes resistentes a los antibióticos en un plásmido IncM2. Este estudio representa, hasta donde sabemos, la primera descripción de una K. pneumoniae del serotipo ST23 y capsular K1 resistente a blaCTX-M-15-, blaOXA-48- y armA gen en España. Nuestro informe enfatiza la importancia de implementar nuevas estrategias de vigilancia para monitorizar el riesgo de emergencia y diseminación de este tipo de aislados de K. pneumoniae XDR e hipervirulentos.