FMM: An R Package for Modeling Rhythmic Patterns in Oscillatory Systems

Abstract

Este artículo está dedicado al paquete R FMM, el cual implementa un enfoque novedoso para describir patrones rítmicos en señales oscilatorias. El modelo de Möbius Modulado en Frecuencia (FMM) se define como una señal paramétrica más un ruido gaussiano, donde la señal puede representarse como una sola onda o como la suma de múltiples ondas.

El enfoque FMM es lo suficientemente flexible para describir una gran variedad de patrones rítmicos. El paquete FMM incluye todas las funciones necesarias para ajustar y explorar modelos FMM de una o múltiples ondas, así como una versión restringida que permite imponer restricciones de igualdad entre parámetros, lo que facilita la incorporación de conocimiento previo sobre la forma de la señal.

Además, el paquete FMM permite generar datos sintéticos y visualizar los resultados del proceso de ajuste. El potencial de esta metodología se ilustra con ejemplos de oscilaciones biológicas, como el ritmo circadiano en la expresión génica, la actividad eléctrica del corazón y la actividad neuronal.