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<dc:title>Análisis de la estructura temporal de la dinámica asociada a la red neuronal funcional para ayudar a la caracterización de la enfermedad de Alzheimer</dc:title>
<dc:creator>Carretero Calvo, Pablo</dc:creator>
<uketdterms:advisor>Gómez Peña, Carlos</uketdterms:advisor>
<uketdterms:advisor>Poza Crespo, Jesús</uketdterms:advisor>
<dcterms:abstract>La enfermedad de Alzheimer (EA) es una de las principales causas de demencia. Los pacientes&#xd;
con EA sufren alteraciones cognitivas, funcionales y conductuales. El principal factor de&#xd;
riesgo es la edad, lo cual hace que esta enfermedad tenga un impacto cada vez más notable debido&#xd;
al aumento en la esperanza de vida. Sin embargo, su diagnóstico sigue siendo un desafío. A&#xd;
pesar de los avances en técnicas diagnósticas respaldadas por evidencia biológica, su disponibilidad&#xd;
generalizada está limitada por su alto coste. En el contexto del rápido desarrollo tecnológico&#xd;
reciente, el análisis de señales de electroencefalografía (EEG), impulsado por diversos algoritmos&#xd;
de computación, está ganando importancia al proponer enfoques innovadores para caracterizar la&#xd;
enfermedad y ayudar en su diagnóstico. En esta línea, este estudio se enfoca en la aplicación de&#xd;
métodos cronectómicos, que cuantifican las propiedades dinámicas de la conectividad funcional&#xd;
cerebral.&#xd;
El análisis se llevó a cabo utilizando dos bases de datos. La primera de ellas incluyó a 160&#xd;
participantes, entre los cuales 67 eran pacientes con EA, 50 tenían deterioro cognitivo leve (DCL)&#xd;
y 43 eran individuos sanos desde el punto de vista cognitivo. La segunda base de datos constó&#xd;
de 126 sujetos, de los cuales 50 eran pacientes con EA, 38 padecían DCL y 38 eran individuos&#xd;
de control. El proceso comenzó con la reconstrucción de la actividad neuronal a nivel de fuente&#xd;
utilizando el algoritmo sLORETA (Standardized Low-Resolution Brain Electromagnetic Tomography).&#xd;
Luego, se identificaron meta-estados cerebrales mediante la aplicación del algoritmo IAC&#xd;
(Instantaneous Amplitude Correlation) en las bandas de frecuencia delta, zeta, alfa y beta-1 para&#xd;
obtener tensores de conectividad funcional instantánea en diversos momentos temporales. A&#xd;
partir de estas matrices de conectividad, se generaron diagramas de recurrencia que mostraban la&#xd;
presencia de meta-estados recurrentes en el tiempo. Utilizando el algoritmo de detección de comunidades&#xd;
Louvain-GJA, se obtuvieron tres meta-estados, que posteriormente se ordenaron según&#xd;
su similitud topológica. Los datos se normalizaron utilizando señales subrogadas para descartar&#xd;
que los resultados surgieran de oscilaciones de origen no neuronal. El proceso de subrogación se&#xd;
optimizó utilizando archivos en C/C++ y procesamiento de datos en la unidad de procesamiento&#xd;
gráfico (GPU). Mediante este enfoque, se generaron tensores de correlación instantánea (ICT)&#xd;
y la secuencia de activación temporal (TAS) que cuantifican la semejanza de las topologías observadas&#xd;
con los meta-estados a lo largo del tiempo. Para resumir las propiedades dinámicas de&#xd;
la red neuronal funcional, se calcularon diversas medidas cronectómicas: singularidad del metaestado&#xd;
dominante, área bajo el ICT, diferencia de permanencia, la probabilidad de ocurrencia del&#xd;
meta-estado nulo, percentil 5º, grado de antagonismo, dwell time, leap size y complejidad de TAS.&#xd;
El análisis detallado de los tensores de correlación instantánea reveló diversos cambios asociados&#xd;
con las alteraciones cerebrales que sufren los pacientes con DCL y EA, principalmente en&#xd;
las bandas zeta y alfa. Estas perturbaciones implican cambios en la comunicación entre regiones&#xd;
cerebrales, aparición de oscilaciones más aleatorias y deterioro de la estabilidad y estructura temporal.&#xd;
Además, se detectaron cambios en la persistencia temporal de los meta-estados, que estaban&#xd;
vinculados a la pérdida de estructura y al aumento de la aleatoriedad. Los resultados de las medidas implementadas se utilizaron para clasificar los tres grupos presentes en la base de datos y para&#xd;
diferenciar entre individuos de control y pacientes (combinando pacientes con DCL y EA). Se&#xd;
emplearon algoritmos de selección de características como el filtro rápido basado en la correlación&#xd;
(FCBF), seleción secuencial de características (SFS) y eliminación recursiva de características&#xd;
(RFE). Para elegir el modelo de clasificación, se utilizó una validación cruzada con 10 particiones&#xd;
de la base de datos. Los modelos de clasificación que mejor rendimiento obtuvieron fueron los&#xd;
árboles de decisión y las redes neuronales. Los resultados de clasificación entre los tres alcanzaron&#xd;
valores de kappa de 0.81 para cada base de datos por separado y 0.63 para la combinación de&#xd;
las bases de datos. En el caso de la clasificación entre controles y la agrupación de pacientes con&#xd;
DCL y EA, se obtuvo valores kappa de 1 para la primera base de datos, de 0.7 para la segunda&#xd;
y 0.68 para la combinación de ambas. En su conjunto, los resultados sugieren que las medidas&#xd;
cronectómicas podrían ser herramientas valiosas para ayudar en el diagnóstico y la caracterización&#xd;
de la EA.</dcterms:abstract>
<dcterms:abstract>Alzheimer’s disease (AD) is one of the main causes of dementia. This condition leads to cognitive,&#xd;
functional, and behavioral changes. The main risk factor is aging, which makes this disease&#xd;
have an increasingly notable impact due to the increase in life expectancy. However, its diagnosis&#xd;
remains a challenge. Despite advances in diagnostic techniques supported by biological evidence,&#xd;
their widespread availability is limited by their high cost. In the context of recent rapid technological&#xd;
development, the analysis of electroencephalography (EEG) signals, driven by various&#xd;
computational algorithms, is gaining importance by proposing innovative approaches to characterize&#xd;
AD. In this line, this study focuses on the application of chronectomic methods, which&#xd;
quantify the dynamic properties of functional connectivity in neuronal associations.&#xd;
The analysis was carried out using two databases. The first one included 160 participants,&#xd;
divided into 67 AD patients, 50 mild cognitive impairment patients, and 43 cognitively healthy&#xd;
individuals. The second database consisted of 126 subjects, among whom 50 were AD patients, 38&#xd;
had mild cognitive impairment, and 38 were cognitively healthy controls. Initially, the neural activity&#xd;
was reconstructed at source level using the sLORETA (Standardized Low-Resolution Brain&#xd;
Electromagnetic Tomography) algorithm. Then, brain meta-states were identified thanks to the&#xd;
application of the IAC (Instantaneous Amplitude Correlation) algorithm in the frequency bands&#xd;
delta, theta, alpha, and beta-1 to obtain instantaneous functional connectivity tensors at various&#xd;
time points. From these connectivity matrices, recurrence plot diagrams showing the presence of&#xd;
recurrent meta-states in time were generated. Using the Louvain-GJA community detection algorithm,&#xd;
three meta-states were obtained; they were subsequently ordered according to their topological&#xd;
similarity. The data were normalized using surrogated signals to rule out that the results&#xd;
arose from random oscillations. The surrogate process was optimized using C/C++ files and GPU&#xd;
data processing. Using this approach, the instantaneous correlation tensors (ICT) and the temporal&#xd;
activation sequence (TAS) were generated indicating the similarity of the observed topologies&#xd;
to the meta-states over time. To summarize the dynamic properties of the functional neural network,&#xd;
multiple chronectomic measures were calculated: uniqueness of the dominant meta-state,&#xd;
area under the ICT, difference in permanence, probability of occurrence of the null meta-state, 5th&#xd;
percentile, degree of antagonism, dewll time, leap size, and TAS complexity.&#xd;
Detailed analysis of the instantaneous correlation tensors revealed several alterations related&#xd;
to MCI and AD, mainly in the theta and alpha bands. These perturbations involve changes in communication&#xd;
between brain regions, appearance of more random oscillations, and impaired temporal&#xd;
stability and structure. In addition, changes in the temporal persistence of meta-states were&#xd;
detected, which were linked to a loss of structure and an increased randomness. The results of&#xd;
the implemented measures were used to classify the three groups present in the database and to&#xd;
differentiate between controls and patients (combining MCI and AD patients). Feature selection&#xd;
algorithms such as fast correlation-based filter (FCBF), sequential forward selection (SFS), and recursive&#xd;
feature elimination (RFE) were used. To choose the classification model, a cross-validation&#xd;
with 10 partitions of the database was used. The best performing classification models were decision trees and neural networks. The classification results among the three groups obtained kappa&#xd;
values of 0.81 for each database separately and 0.63 for the combination of databases. In the case&#xd;
of classification between controls and the grouping of patients with MCI and AD, kappa values&#xd;
of 1 were obtained for the first database, 0.7 for the second, and 0.68 for the combination of both&#xd;
databases. Taken together, the results suggest that chronectomic measures could be valuable tools&#xd;
to support the diagnosis and characterization of AD.</dcterms:abstract>
<dcterms:issued>2023</dcterms:issued>
<dc:type>info:eu-repo/semantics/masterThesis</dc:type>
<dc:language xsi:type="dcterms:ISO639-2">spa</dc:language>
<uketdterms:sponsor>Departamento de Teoría de la Señal y Comunicaciones e Ingeniería Telemática</uketdterms:sponsor>
<dcterms:isReferencedBy>https://uvadoc.uva.es/handle/10324/63129</dcterms:isReferencedBy>
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<dc:rights>Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional</dc:rights>
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