RT info:eu-repo/semantics/article T1 The Genome Sequence of Taurine Cattle: A Window to Ruminant Biology and Evolution A1 Elsik, Christine G. A1 Tellam, Ross L. A1 Worley, Kim C. A1 Gibbs, Richard A. A1 Muzny, Donna M. A1 Weinstock, George M. A1 Adelson, David L. A1 Eichler, Evan E. A1 Elnitski, Laura A1 Guigó, Roderic A1 Hamernik, Debora L. A1 Kappes, Steve M. A1 Lewin, Harris A. A1 Lynn, David J. A1 Nicholas, Frank W. A1 Reymond, Alexandre A1 Rijnkels, Monique A1 Skow, Loren C. A1 Zdobnov, Evgeny M. A1 Schook, Lawrence A1 Womack, James A1 Alioto, Tyler A1 Antonarakis, Stylianos E. A1 Astashyn, Alex A1 Chapple, Charles E. A1 Chen, Hsiu-Chuan A1 Chrast, Jacqueline A1 Câmara, Francisco A1 Ermolaeva, Olga A1 Henrichsen, Charlotte N. A1 Hlavina, Wratko A1 Kapustin, Yuri A1 Kiryutin, Boris A1 Kitts, Paul A1 Kokocinski, Felix A1 Landrum, Melissa A1 Maglott, Donna A1 Pruitt, Kim A1 Sapojnikov, Victor A1 Searle, Stephen M. A1 Solovyev, Victor A1 Souvorov, Alexandre A1 Ucla, Catherine A1 Wyss, Carine A1 Anzola, Juan M. A1 Gerlach, Daniel A1 Elhaik, Eran A1 Graur, Dan A1 Reese, Justin T. A1 Edgar, Robert C. A1 McEwan, John C. A1 Payne, Gemma M. A1 Raison, Joy M. A1 Junier, Thomas A1 Kriventseva, Evgenia V. A1 Eyras, Eduardo A1 Plass, Mireya A1 Donthu, Ravikiran A1 Larkin, Denis M. A1 Reecy, James A1 Yang, Mary Q. A1 Chen, Lin A1 Cheng, Ze A1 Chitko-McKown, Carol G. A1 Liu, George E. A1 Matukumalli, Lakshmi K. A1 Song, Jiuzhou A1 Zhu, Bin A1 Bradley, Daniel G. A1 Brinkman, Fiona S.L. A1 Lau, Lilian P.L. A1 Whiteside, Matthew D. A1 Walker, Angela A1 Wheeler, Thomas T. A1 Casey, Theresa A1 German, J. Bruce A1 Lemay, Danielle G. A1 Maqbool, Nauman J. A1 Molenaar, Adrian J. A1 Seo, Seongwon A1 Stothard, Paul A1 Baldwin, Cynthia L. A1 Baxter, Rebecca A1 Brinkmeyer-Langford, Candice L. A1 Brown, Wendy C. A1 Childers, Christopher P. A1 Connelley, Timothy A1 Ellis, Shirley A. A1 Fritz, Krista A1 Glass, Elizabeth J. A1 Herzig, Carolyn T.A. A1 Iivanainen, Antti A1 Lahmers, Kevin K. A1 Bennett, Anna K. A1 Dickens, C. Michael A1 Gilbert, James G.R. A1 Hagen, Darren E. A1 Salih, Hanni A1 Aerts, Jan A1 Caetano, Alexandre R. A1 Dalrymple, Brian A1 Garcia, Jose Fernando A1 Gill, Clare A. A1 Hiendleder, Stefan G. A1 Memili, Erdogan A1 Spurlock, Diane A1 Williams, John L. A1 Alexander, Lee A1 Brownstein, Michael J. A1 Guan, Leluo A1 Holt, Robert A. A1 Jones, Steven J.M. A1 Marra, Marco A. A1 Moore, Richard A1 Moore, Stephen S. A1 Roberts, Andy A1 Taniguchi, Masaaki A1 Waterman, Richard C. A1 Chacko, Joseph A1 Chandrabose, Mimi M. A1 Cree, Andy A1 Dao, Marvin Diep A1 Dinh, Huyen H. A1 Gabisi, Ramatu Ayiesha A1 Hines, Sandra A1 Hume, Jennifer A1 Jhangiani, Shalini N. A1 Joshi, Vandita A1 Kovar, Christie L. A1 Lewis, Lora R. A1 Liu, Yih-shin A1 Lopez, John A1 Morgan, Margaret B. A1 Nguyen, Ngoc Bich A1 Okwuonu, Geoffrey O. A1 Ruiz, San Juana A1 Santibanez, Jireh A1 Wright, Rita A. A1 Buhay, Christian A1 Ding, Yan A1 Dugan-Rocha, Shannon A1 Herdandez, Judith A1 Holder, Michael A1 Sabo, Aniko A1 Egan, Amy A1 Goodell, Jason A1 Wilczek-Boney, Katarzyna A1 Fowler, Gerald R. A1 Hitchens, Matthew Edward A1 Lozado, Ryan J. A1 Moen, Charles A1 Steffen, David A1 Warren, James T. A1 Zhang, Jingkun A1 Chiu, Readman A1 Schein, Jacqueline E. A1 Durbin, K. James A1 Havlak, Paul A1 Jiang, Huaiyang A1 Liu, Yue A1 Qin, Xiang A1 Ren, Yanru A1 Shen, Yufeng A1 Song, Henry A1 Bell, Stephanie Nicole A1 Davis, Clay A1 Johnson, Angela Jolivet A1 Lee, Sandra A1 Nazareth, Lynne V. A1 Patel, Bella Mayurkumar A1 Pu, Ling-Ling A1 Vattathil, Selina A1 Williams, Rex Lee A1 Curry, Stacey A1 Hamilton, Cerissa A1 Sodergren, Erica A1 Wheeler, David A. A1 Barris, Wes A1 Bennett, Gary L. A1 Eggen, André A1 Green, Ronnie D. A1 Harhay, Gregory P. A1 Hobbs, Matthew A1 Jann, Oliver A1 Keele, John W. A1 Kent, Matthew P. A1 Lien, Sigbjørn A1 McKay, Stephanie D. A1 McWilliam, Sean A1 Ratnakumar, Abhirami A1 Schnabel, Robert D. A1 Smith, Timothy A1 Snelling, Warren M. A1 Sonstegard, Tad S. A1 Stone, Roger T. A1 Sugimoto, Yoshikazu A1 Takasuga, Akiko A1 Taylor, Jeremy F. A1 Van Tassell, Curtis P. A1 MacNeil, Michael D. A1 Abatepaulo, Antonio R.R. A1 Abbey, Colette A. A1 Ahola, Virpi A1 Almeida, Iassudara G. A1 Amadio, Ariel F. A1 Anatriello, Elen A1 Bahadue, Suria M. A1 Biase, Fernando H. A1 Boldt, Clayton R. A1 Carroll, Jeffery A. A1 Carvalho, Wanessa A. A1 Cervelatti, Eliane P. A1 Chacko, Elsa A1 Chapin, Jennifer E. A1 Cheng, Ye A1 Choi, Jungwoo A1 Colley, Adam J. A1 de Campos, Tatiana A. A1 De Donato, Marcos A1 Santos, Isabel K.F. de Miranda A1 de Oliveira, Carlo J.F. A1 Deobald, Heather A1 Devinoy, Eve A1 Donohue, Kaitlin E. A1 Dovc, Peter A1 Eberlein, Annett A1 Fitzsimmons, Carolyn J. A1 Franzin, Alessandra M. A1 Garcia, Gustavo R. A1 Genini, Sem A1 Gladney, Cody J. A1 Grant, Jason R. A1 Greaser, Marion L. A1 Green, Jonathan A. A1 Hadsell, Darryl L. A1 Hakimov, Hatam A. A1 Halgren, Rob A1 Harrow, Jennifer L. A1 Hart, Elizabeth A. A1 Hastings, Nicola A1 Hernández Pérez, Marta A1 Hu, Zhi-Liang A1 Ingham, Aaron A1 Iso-Touru, Terhi A1 Jamis, Catherine A1 Jensen, Kirsty A1 Kapetis, Dimos A1 Kerr, Tovah A1 Khalil, Sari S. A1 Khatib, Hasan A1 Kolbehdari, Davood A1 Kumar, Charu G. A1 Kumar, Dinesh A1 Leach, Richard A1 Lee, Justin C-M A1 Li, Changxi A1 Logan, Krystin M. A1 Malinverni, Roberto A1 Marques, Elisa A1 Martin, William F. A1 Martins, Natalia F. A1 Maruyama, Sandra R. A1 Mazza, Raffaele A1 McLean, Kim L. A1 Medrano, Juan F. A1 Moreno, Barbara T. A1 Moré, Daniela D. A1 Muntean, Carl T. A1 Nandakumar, Hari P. A1 Nogueira, Marcelo F.G. A1 Olsaker, Ingrid A1 Pant, Sameer D. A1 Panzitta, Francesca A1 Pastor, Rosemeire C.P. A1 Poli, Mario A. A1 Poslusny, Nathan A1 Rachagani, Satyanarayana A1 Ranganathan, Shoba A1 Razpet, Andrej A1 Riggs, Penny K. A1 Rincon, Gonzalo A1 Rodriguez-Osorio, Nelida A1 Rodriguez-Zas, Sandra L. A1 Romero, Natasha E. A1 Rosenwald, Anne A1 Sando, Lillian A1 Schmutz, Sheila M. A1 Shen, Libing A1 Sherman, Laura A1 Southey, Bruce R. A1 Lutzow, Ylva Strandberg A1 Sweedler, Jonathan V. A1 Tammen, Imke A1 Telugu, Bhanu Prakash V.L. A1 Urbanski, Jennifer M. A1 Utsunomiya, Yuri T. A1 Verschoor, Chris P. A1 Waardenberg, Ashley J. A1 Wang, Zhiquan A1 Ward, Robert A1 Weikard, Rosemarie A1 Welsh, Thomas H. A1 White, Stephen N. A1 Wilming, Laurens G. A1 Wunderlich, Kris R. A1 Yang, Jianqi A1 Zhao, Feng-Qi AB La secuencia proviene de un ejemplar bovino de la raza Hereford, en concreto una vaca denominada L1 Dominette 01449, nacida el 14 de abril de 2001, hija del macho Hereford, llamado L-1 Domino 99375, propiedad ambos del USDA Agricultural Research Service’s Livestock & Range Research Laboratory (Miles, Montana, Estados Unidos). El genoma de la vaca Dominette fue secuenciado a partir de ADN purificado de células blancas de sangre extraídas al animal. Una vez obtenido el ADN provisto se secuenció empleando secuenciadores automáticos, combinando la tecnología de secuenciación del genoma entero Whole Genome Shotgun Sequence (WGS) con estrategias de secuenciación ordenada (secuenciación de "Bacterial Artificial Chromosomes", BAC a BAC). Una vez ensamblada la secuencia se procedió a la anotación bioinformática utilizando el Otterlace software creado por el grupo HAVANA (Human And Vertebrate Analysis aNd Annotation) con el cual tuve la oportunidad de ser formada. El genoma de la vaca se reparte entre los 29 cromosomas autosómicos más el cromosoma sexual X. El tamaño del genoma de la vaca resultó de 2.870 Mpb. En esta secuencia más del 95% del total fue ADN no codificante, basura o junk DNA y la parte codificante, codifica 22.000 genes, de los cuales 18.000 se anotaron automáticamente y 4.000 fueron anotados manualmente. SN 0036-8075 YR 2009 FD 2009 LK https://uvadoc.uva.es/handle/10324/65734 UL https://uvadoc.uva.es/handle/10324/65734 LA spa NO Bovine Genome Sequencing and Analysis Consortium; Elsik CG, Tellam RL, Worley KC, Gibbs RA, Muzny DM, Weinstock GM, Adelson DL, Eichler. The genome sequence of taurine cattle: a window to ruminant biology and evolution. Science. 2009 Apr 24;324(5926):522-8. doi: 10.1126/science.1169588. PMID: 19390049; PMCID: PMC2943200 DS UVaDOC RD 03-oct-2025