La cultura copta ha quedado eclipsada en Egipto por la faraónica y la islámica, a pesar de la importancia que tuvo en los primeros siglos del cristianismo. Los árabes, en principio tolerantes con los cristianos, permitieron que el entorno de la fortaleza romana de Babylon adquiriera para ellos una especial relevancia, que aumentaría cuando en el siglo XI se trasladó allí la sede patriarcal desde Alejandría. En este contexto destaca la iglesia de los Santos Sergio y Baco, considerada la más antigua con culto de África y a la que la tradición asocia la presencia de la Sagrada Familia. Tras la restauración llevada a cabo por un equipo hispano-egipcio entre 1999 y 2004, y las excavaciones arqueológicas a las que se asociaron en parte sus trabajos, la historia de esta iglesia y de su entorno se reescribe.
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