Comparación de la comunidad microbiana en fotobiorreactores tratando purines de cerdo

Abstract

En este trabajo se utilizó la técnica DGGE (electroforesis en gel desnaturalizante en gradiente) para comparar la comunidad microbiana en 4 fotobiorreactores tratando purines de cerdo, en diferentes concentraciones (1:10, 1:20) y condiciones de luz y temperatura (indoor, outdoor). Tras la extracción del ADN genómico y amplificación por PCR de las regiones V6-V8 del ARNr bacteriano, se analizaron los amplicones mediante DGGE, obteniendo el perfil electroforético de cada muestra. Según el índice de Diversidad de Shannon-Wiener, la diversidad bacteriana fue media (2.6 en 3 reactores) o baja (2.1 en el reactor 1:20 outdoor). El índice de similaridad mostró poca variabilidad entre las muestras, siendo las más semejantes entre sí las de los reactores indoor (83.4%). Las bacterias identificadas a partir de las bandas más significativas de cada perfil electroforético, utilizando las bases de datos RDP y BLAST, pertenecen mayoritariamente al filo Proteobacteria, siendo especialmente representativo el género Psychrobacter.