Aplicación de MALDI-TOF para el análisis rápido de Escherichia coli verotoxigénica

Abstract

Escherichia coli es una bacteria de la familia Enterobacteriaceae que está presente en el intestino humano, siendo la mayoría de sus cepas inocuas. No obstante, otras cepas Escherichia coli son productoras de Toxinas Shiga (STEC) y causan enfermedades tales como colitis hemorrágica y síndrome urémico hemolítico. Para aplicar un tratamiento eficaz a nivel clínico se necesita una rápida identificación a través de técnicas fiables como la espectrometría de masas MALDI-TOF. Nuestro objetivo es estudiar biomarcadores para diferenciar E. coli O157 productora de toxinas Shiga a través de los espectros de masas obtenidos por la técnica MALDI-TOF. En el presente trabajo se estudian cepas de E. coli O157 y no O157 mediante MALDI-TOF MS para encontrar biomarcadores que permitan su diferenciación. El estudio del espectro de masas mediante el programa ClinProTools permitió discriminar claramente las E. coli O146 de las E. coli O157. A través de este programa, se encontraron cuatro fragmentos presentes en E. coli O146 pero no en O157: 3445,66 m/z; 5457,35 m/z; 8326,01 m/z; 9062,78 m/z. A partir de estos fragmentos fue posible generar modelos de discriminación: Algoritmo Genético Optimizado (GA), Red Neuronal Supervisada (SNN) y Clasificador Rápido (QC). Su comprobación se llevó a cabo mediante validación externa, alcanzándose un 100 %. Fue posible generar modelos capaces de separar E. coli O146 de E. coli O157, pero no se consiguió diferenciar los serotipos O157:H7 y O157:H-.